Brandon Lee'nin ölümü de babasının ölümü gibi ani ve beklenmedik bir şekilde olmuştur. Lee, The Crow (film)'inin çekimlerinin bitmesine sekiz gün kala, 31 Mart 1993 tarihinde, çekimler sırasında yanlışlıkla doldurulmuş bir silah ile vurularak hayatını kaybetmiştir. Olay, Lee'nin evlenmesine yalnızca iki hafta kala meydana gelmiştir.

Brandon Lee'nin ölümünden sonra nişanlısı Eliza Hutton ve annesi, The Crow filminin yapımcısı Alex Proyas'den filmi tamamlayıp yayınlanmasını istemiştir. Bunun üzerine son sahneler Brandon Lee olmadan tamamlanmış ve film bu şekilde yayınlanmıştır. Günümüzde 4. serisi de yayınlanan film büyük bir hayranlık uyandırmış ve kült bir yapım olmuştur.

Ölümünden sonra Brandon Lee'nin mezarı babası Bruce Lee'nin yanına yapılmıştır.